清華大學宜蘭園區於95至99年間通過環境影響評估,99年5月依宜蘭縣政府同意補助函為財源,發包雜項工程,開始園區基礎工程建設。惟,清華大學因校務會議決議不動支校務基金投入宜蘭園區開發,而園區募款工作無著,開發工作陷於停頓。
此時,宜蘭大學因現有校地不足,企待擴增,表意希接手園區開發,獲清華大學同意,宜蘭縣政府亦表樂觀其成,101年10月3日教育部召集三方會議研商,訂定宜蘭園區未來發展方向將由清大與宜大合作開發,清華大學保留第7區0.9公頃做為創新育成中心,配合竹科之宜蘭城南基地發展,且最遲應於104年3月底前啟動,否則將予撤案之議定。
其後,清華大學與宜蘭大學於102年7月23日併案提送「國立宜蘭大學城南校區(綠能智慧園)籌設計畫書」,教育部於102年10月15日函復審查意見,2校共同修正後,復以103年3月21日報送修正計畫書到部,經2度審查及修正,於103年6月21日102學年度大學校院設立變更及停辦審議會第3次會議獲原則通過,104年1月28日獲教育部核定准予籌設宜蘭大學城南校區。